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伊豆諸島?鳥島の東北東で一夜にして小島が海中に沒した?，F(xiàn)場調(diào)査に急行した深海潛水艇の操艇者?小野寺俊夫は、地球物理學の権威?田所博士とともに日本海溝の底で起きている深刻な異変に気づく。折から日本各地で大地震や火山の噴火が続発。日本列島に驚くべき事態(tài)が起こりつつあるという田所博士の警告を受け、政府も極秘プロジェクトをスタートさせ、日本人を全員海外へ移住させるべく、極秘裏に世界各國との交渉に入った。小野寺も姿を隠して、計畫に參加するが、関東地方を未曾有の大地震が襲い、東京は壊滅狀態(tài)となってしまう。そして日本沈沒の日は予想外に早くやってきた。日本人は生き殘れるのか。全國民必読。